課程資訊
課程名稱
合成生物學
Synthetic Biology - Design, Engineering and Evolution 
開課學期
105-2 
授課對象
電機資訊學院  電子工程學研究所  
授課教師
周信宏 
課號
LS5085 
課程識別碼
B21 U2290 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三3,4(10:20~12:10) 
上課地點
生科3C 
備註
與黃筱鈞合開
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1052LS5085_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

課堂中將講授基因選殖、誘變、演化篩選、電腦模擬與基因迴路的設計原理,介紹並討論經典與近期的合成生物學研究報告,學生將依研究興趣及專長分組於期末提出新的合成生物學方法或應用。 

課程目標
學生暸解合成生物學的原理及應用,透過獨立思考及團隊合作構思嶄新的實驗技術、分析方法、以及在生技產業上的應用價值。 
課程要求
1.學生須事前閱讀教材並於課堂上積極參與討論。
2.學生須已修習普通生物學以及下列任一課程:生物化學、分子生物學、遺傳學、細胞生物學、微生物學、計算機程式設計、生物資訊學
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
1.Synthetic Biology (Methods in Molecular Biology 1073), 2013
2.An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits, by Uri Alon (Chapman & Hall/CRC Mathematical & Computational Biology), 2006.
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
課程參與 
15% 
出席、參與討論 
2. 
口頭報告一 
20% 
小組 40 分鐘口頭報告 
3. 
口頭報告二 
20% 
小組 40 分鐘口頭報告 
4. 
小組研究計畫書 
25% 
4/12: 一頁 6/16: 至多六頁 
5. 
期末口頭報告 
20% 
小組 16 分鐘口頭報告, 4 分鐘答辯 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/22  [Video] Introduction of synthetic biology 
第2週
3/01  [Lecture] Methodology of cloning, mutagenesis, and selection 
第4週
3/15  [Lecture] Noise, robustness and stochastic modeling approach 
第5週
3/22  [Literature presentation] Computational design and high-throughput construction of regulatory elements 
第6週
3/29  [Literature presentation] Deep mutational scanning 
第7週
4/05  溫書假 
第8週
4/12  [Literature presentation] Directed evolution of proteins 
第9週
4/19  [Literature presentation] Metabolic engineering 
第10週
4/26  [Discussion] Proposing the team project 
第11週
5/03  [Literature presentation] de novo genome synthesis 
第12週
5/10  [Literature presentation] Toggle switch and cell differentiation 
第13週
5/17  [Literature presentation] Repressilator and circadian clocks 
第14週
5/24  [Literature presentation] Positive feedback and cell polarity 
第15週
5/31  [Literature presentation] Cell-cell communications and pattern formation 
第16週
6/07  [Literature presentation] Genome engineering 
第17週
6/14  Team project presentation 
第3-1週
3/06  [Optional] Seminar by Dr. James Liao
Time: 15:30-17:20
Location: Rm. 332, Life Science Bldg.
Synthetic Biology: Re-Designing Metabolism for Carbon Management 
第3-2週
3/08  [Lecture] Network motif, design principles and deterministic modeling approach